Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rdh16O54909 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rdh16O54909 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rdh16O54909 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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