Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cavin1O54724 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cavin1O54724 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms