Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Slc27a2O35488 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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