Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Prrt1O35449 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms