Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx3O35160 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms