Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2035J3QP87 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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