Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ms4a18J3QN01 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.7 ms