Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20834J3QM72 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20834J3QM72 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20834J3QM72 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20834J3QM72 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20834J3QM72 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20834J3QM72 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20834J3QM72 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20834J3QM72 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20834J3QM72 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20834J3QM72 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20834J3QM72 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20834J3QM72 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20834J3QM72 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20834J3QM72 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm20834J3QM72 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm20834J3QM72 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm20834J3QM72 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm20834J3QM72 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm20834J3QM72 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm20834J3QM72 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm20834J3QM72 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20834J3QM72 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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