Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17535J3KMR8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm17535J3KMR8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm17535J3KMR8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm17535J3KMR8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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