Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm28048F7BCN0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28048F7BCN0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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