Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syngap1F6SEU4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms