Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmod3E9QA62 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms