Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm20518E9Q548 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm20518E9Q548 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm20518E9Q548 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20518E9Q548 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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