Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cspp1B2RX88 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms