Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rrn3B2RS91 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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