Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtf1A2AQ19 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Rtf1A2AQ19 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Rtf1A2AQ19 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtf1A2AQ19 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Rtf1A2AQ19 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Rtf1A2AQ19 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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Rtf1A2AQ19 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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Rtf1A2AQ19 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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Rtf1A2AQ19 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Rtf1A2AQ19 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Rtf1A2AQ19 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Rtf1A2AQ19 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Rtf1A2AQ19 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Rtf1A2AQ19 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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