Protein–RNA interactions for Protein: A2A7Q9

Rnf19b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19bA2A7Q9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf19bA2A7Q9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms