Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm16958-202ENSMUST00000181792 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm3532-201ENSMUST00000181880 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Gm42435-201ENSMUST00000196630 1448 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3238W4VSP7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms