Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd3Q9Z2D8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms