Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Stxbp4Q9WV89 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Stxbp4Q9WV89 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms