Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek3Q9R0A5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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