Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rdh11Q9QYF1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rdh11Q9QYF1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rdh11Q9QYF1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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