Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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Kcnip3Q9QXT8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Kcnip3Q9QXT8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Kcnip3Q9QXT8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Kcnip3Q9QXT8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kcnip3Q9QXT8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms