Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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