Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SrfQ9JM73 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms