Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capn12Q9ER56 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms