Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clstn1Q9EPL2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms