Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syde1Q9DBZ9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syde1Q9DBZ9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms