Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Swt1Q9DBQ9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Swt1Q9DBQ9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Swt1Q9DBQ9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Swt1Q9DBQ9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Swt1Q9DBQ9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Swt1Q9DBQ9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Swt1Q9DBQ9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms