Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Alkbh4Q9D8F1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Alkbh4Q9D8F1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms