Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vstm5Q9D806 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms