Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Capns2Q9D7J7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Capns2Q9D7J7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms