Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn23Q9D7D7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Cldn23Q9D7D7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn23Q9D7D7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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