Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tube1Q9D6T1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms