Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrp2bpQ9D4C6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms