Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syce1Q9D495 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms