Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrnp35Q9D384 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrnp35Q9D384 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms