Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramef12Q9D2F1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms