Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Cnot11Q9CWN7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Cnot11Q9CWN7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Cnot11Q9CWN7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cnot11Q9CWN7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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