Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL2

Casz1, Zinc finger protein castor homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casz1Q9CWL2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Casz1Q9CWL2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casz1Q9CWL2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casz1Q9CWL2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casz1Q9CWL2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Casz1Q9CWL2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Casz1Q9CWL2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casz1Q9CWL2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casz1Q9CWL2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Casz1Q9CWL2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Casz1Q9CWL2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Casz1Q9CWL2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Casz1Q9CWL2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms