Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Dis3Q9CSH3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dis3Q9CSH3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dis3Q9CSH3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms