Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Filip1Q9CS72 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Filip1Q9CS72 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms