Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ifitm3Q9CQW9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ifitm3Q9CQW9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms