Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ykt6Q9CQW1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ykt6Q9CQW1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms