Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufb9Q9CQJ8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms