Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc5Q9CQA1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms