Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Pkp2Q9CQ73 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkp2Q9CQ73 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms