Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpa3Q9CQ71 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpa3Q9CQ71 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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