Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NsmfQ99NF2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NsmfQ99NF2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms