Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrtQ99MR6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrtQ99MR6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms